Nach Altomünster kamen die Menschen vor allem wegen der umfangreichen Reliquiensammlung. Denn der Reichtum eines Klosters des Mittelalters bestand nicht nur in seinem Grundbesitz und seinen Rechten, sondern auch aus vielen Reliquien, die von den Gläubigen der Region und von Wallfahrern verehrt wurden. Solche Wallfahrten und Bittgänge haben zur Verbesserung der Einkommenssituation des Klosters beigetragen. In Altomünster verehrte man (teilw.zu unterschiedlichen Zeiten):
- von Klostergründer St.Alto

die Hirnschale, sein Rodungsmesser, zwei Bücher (heute in der Staatsbibliothek) sonstige Gebeine den berühmten Altokelch (später bei der Säkularisation eingeschmolzen)

- von der hl. Birgitta

ein "großes Röhrenstück" der Gebeine einen schwarzen Ärmel ihres Rockes ein Stück ihres Tisches ein Agnus Dei, das Birgitta am Hals getragen hat eine Trinkschale und den Wanderstab.

-  von St.Catharina, der Tochter von Birgitta, ein "Beinlein wohl ein Spann lang"
- weitere Reliquien im Kloster

ein Kreuz, das Kaiser Karl IV. 1356 dem Kloster geschenkt hat sieben "Heilige Leiber", die hinter den Altarbildern angebracht sind eine am Original berührte Kopie des Turiner Leichentuchs drei Kreuzpartikel, zwei Dornen aus der Dornenkrone Christi Haare von der Gottesmutter Maria heilkräftiges Wasser aus der von St.Alto wundersam erweckten Quelle